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水生态流域管理系统是为了实现流域内水资源、水环境、生态保护、水灾防治等综合管理优化而设计的一种系统。它可以对流域内的水文水资源、水生态、水环境、水生物资源等情况进行全面的数据收集、分析与处理，并提供可视化的管理工具和决策支持系统，从而为流域管理提供全面、科学、有效的决策支持。水生态流域管理系统有助于提高流域内水资源利用效率，保护水生态环境，防治洪涝灾害，促进经济社会可持续发展。
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